В настоящий момент в структуру Карлова университета входят 17 факультетов, 3 института и 6 центров образовательной, научной и исследовательской деятельности.
Факультеты:
- Католический теологический факультет (подготовка в области искусства и теологии)
- Протестантский теологический факультет (богословская подготовка)
- Гуситский теологический факультет (богословская подготовка)
- Юридический факультет (подготовка специалистов в области юриспруденции и права)
- Первый медицинский факультет (все направления медицины, включая стоматологию)
- Второй факультет медицины (специализация – педиатрия)
- Третий медицинский факультет (общая медицина и сестринский уход)
- Медицинский факультет в г. Пльзень (общая медицина и стоматология)
- Медицинский факультет в г. Градец Кралове (общая медицина и стоматология)
- Фармацевтический факультет в г. Градец Кралове (подготовка специалистов-фармацевтов и вспомогательные курсы для учащихся прочих мед. специальностей)
- Философский факультет ( специализации – философия, гуманитарные науки, история, библиотечное дело, филология, педагогика, история искусства и культуры)
- Факультет естественных наук (геология, география, демография, биохимия, химия, биология, защита окружающей среды)
- Физико-математический факультет (специализации – физика, математика, информатика)
- Педагогический факультет (подготовка педагогов, психологов и топ-менеджмента в области образования)
- Факультет социальных наук (в его состав входят Институт коммуникации и журналистики, Институт политологии и международных отношений, Институт международных страноведений, Институт экономических наук и Институт социологии)
- Факультет физического воспитания и спорта (педагогика и менеджмент)
- Гуманитарный факультет (гуманитарные науки, экология и охрана окружающей среды, философия, социальная политика и социальные работы, медиа и коммуникации).
Столь обширный выбор факультетов позволяет получить в Карловом университете высшее образование практически по любой специальности, будь то компьютерные технологии, экономика, менеджмент, искусствоведение или физика. Традиционно одним из сильнейших направлений считается медицина, этой специальности обучается в общей сложности 8 000 человек.
Большой популярностью пользуется юридический факультет, где учатся свыше 4 000 человек. Конкурс там составляет около 10 человек на место. 6 500 студентов получают образование на философском факультете, предлагающем более 40 специальностей. Многие студенты изучают здесь социологию и культурологию. Самая популярная специализация – психология: конкурс доходит до 30 человек на место. Есть возможность изучать несколько направлений и получить по окончанию «двойной» диплом.
Всего на бакалаврских программах обучается порядка 19 000 студентов, в магистратуре Карлова университета учится чуть менее 25 000 человек и почти 8 000 получают степень PhD.
Преподавательский состав насчитывает свыше 8000 человек. Помимо штатных сотрудников занятия также проводят приглашенные лекторы из ведущих университетов мира.